Каждая виртуальная собака и кошка имеет уникальный окрас, а также определенный пол и характер. Последнее играет очень важную роль в отношениях с пользователем. Поэтому во время игры следует использовать соответствующие методы обучения, чтобы правильно сформировать представителя конкретной породы. Микрофон позволяет научить питомца реагировать на голосовые команды, а сенсорный экран позволяет взаимодействовать с питомцем (гладить, мыть, выводить на прогулку). Домашние животные также охотно реагируют на игру и радуются, когда мы даем им различные предметы (ошейники, фрисби, шерстяные клубки и т. д.). Взамен они участвуют в конкурсах и выставках, завоевывая внушительные призы.

Каждая версия Nintendogs + Cats также предлагает ряд функций, напрямую связанных с функциями Nintendo 3DS. Поэтому в постановке Сигэру Миямото используются 3D-технологии и сенсорный экран. С помощью камеры также позволяет отображать, например, фрагмент комнаты игрока на экране, превращая его в игровое пространство для щенков и котят (так называемая дополненная реальность). Домашние животные также положительно реагируют на вид своего хозяина. Такой тип взаимодействия обеспечивает система распознавания лиц игрока (с помощью одной из камер, встроенных в консоль). Прогуливаясь по городу с включенным 3DS, вы, в свою очередь, можете привести к виртуальной встрече с собакой или кошкой другого игрока (функция StreetPass).