Основой, как и раньше, является прочесывание подземелий, но в «4» мы посетим еще множество мест подобного типа. Игрок создает команду, состоящую из представителей (изначально) семи профессий: Мечника, Медика, Крепостника, Мастера рун, Ночного Искателя, Снайпера и Танцора. У каждого свой набор навыков, поэтому правильное управление навыками — ключ к успеху.

Мы открываем новые подземелья, путешествуя по карте мира, которая была развитием концепции, представленной в третьей части. Мы можем путешествовать на воздушном шаре, но будьте осторожны, потому что за пределами подземелий враги явно сильнее, особенно драконы, которые могут время от времени нападать на вас. Еще одна новинка, связанная с картой, — это возможность выращивать урожай, который затем можно использовать для увеличения статистики или заработка денег.

Что касается боевой системы, то бои в EOIV, конечно же, пошаговые. Всего игроку доступно десять профессий, что на две меньше, чем в «Три-Три», но навыки заброшенных создателями профессий были перенесены в другие классы. Новинкой по сравнению с предшественниками являются трехмерные модели монстров (вместо спрайтов).

В случае с четвертой частью Etrian Odyssey создатели намеревались охватить менее продвинутых игроков, примером чего является реализация казуального режима. Это более низкий уровень сложности с несколькими значительными улучшениями, например отсутствием завершения игры. Провал больше не завершает игру, вместо этого мы переносимся обратно на Тарсис, местную базу.